Ethan Hunt y el personal del FMI unen fuerzas con el asesino de la CIA August Walker para evitar una tragedia de proporciones épicas. El proveedor de armas John Lark y también un grupo de terroristas conocidos como los Apóstoles tienen la intención de utilizar núcleos de plutonio tridimensionales para un ataque atómico simultáneo en el Vaticano, Jerusalén y La Meca, Arabia Saudita.