Depuis 2003 un marine Sergent Nicholas Brody est considéré comme disparu ou tué dans une bataille mais pendant une opération spéciale il est trouvé dans une base des terroristes en Irak. L'agent de C.I.A. Carrie Mathison est informé que Brody a rejoint les al Qaeda et elle veut le prouver. Elle doit faire face à un grand problème – tout le monde pense qu'il est un héros de guerre.