Au centre de l'intrigue se trouve le dieu de la tromperie et de la tromperie, Loki, qui parvient à s'emparer du Tesseract et à s'échapper pendant le chaos. Avant de pouvoir pleinement profiter de sa liberté, il est capturé par des soldats inconnus qui l'escortent vers un endroit étrange et complètement inconnu. Il devient vite évident qu'il a été conduit à l'Autorité de la Variance Temporelle, où il sera jugé pour avoir violé la Ligne Temporelle Sacrée. Et après avoir été condamné à une “réinitialisation”, Loki trouve inopinément le salut sous la forme de l'agent Mobius, qui lui offre son aide en échange de sa coopération.